更新履歴

[ABINIT-MP Homepage]

• NISTへのリンクを修正しました。
• MPICH2のWindows向け解説を更新しました。

• MPICH2のWindows向け解説を更新しました。

• MPICH2のWindows向け解説を更新しました。

• Basis setsのリンクを修正しました。

• MPICH2のWindows向け解説とサンプルプログラムを掲載しました。

• ソフトウェアへのリンクを修正しました。

• Javaへのリンクを修正しました。

• 「戦略的基盤ソフトウェアの開発」および「革新的シミュレーションソフトウェアの研究開発」へのリンクを修正しました。

• 研究機構 のリンクを修正しました。

• 「革新的シミュレーション研究センター (CISS)」へのリンクを修正しました。
• 学会 のリンクを修正しました。

• MPICH2環境の構築 のリンクを修正しました。

• 分子計算ソフトウェア のリンクを修正しました。
• 学会 のリンクを追加しました。

• NWChemへのリンクを削除しました。
• Basis setsのリンクを修正しました。
• 大学 へのリンクを削除しました。
• 研究機構 のリンクを修正しました。
• その他 のリンクを修正しました。

• 支援を受けたプロジェクトのリストを修正しました。
• RCSB Protein Data Bank (PDB)へのリンクを修正しました。
• ソフトウェアへのリンクを修正しました。

• MPICH2へのリンクを修正しました．また，MPICH2のWindows XP / Vista へのインストール方法の資料を更新しました．
• Fortran Compilers を削除しました．

• MPICH2へのリンクを修正しました．また，MPICH2のWindows XP / Vista へのインストール方法の資料を掲載しました．
• JavaとJava 3Dへのリンクを修正しました．
• EMSL Gaussian Basis Set Order Form へのリンクを修正しました．
• FFFTP の記述を削除しました．
• Microsoft PowerToys の記述を削除しました．

• Webページのメンテナンスを再開しました。

• ABINIT-MP Ver.20020626 のソースコードを掲載しました。
  • 変数が初期化されていないバグを修正しました。
  • 変数名が31文字を超えているバグを修正しました。
  • abinitmp20020626.exe Windows 自己解凍形式。338KB。
  • abinitmp20020626.tar.Z UNIX tar.Z形式。360KB。uncompress < abinitmp20020626.tar.Z | tar xf - で解凍してください。

• ABINIT-MP Ver.20020516 のソースコードを掲載しました。フラグメント間相互作用解析機能を追加しました。またCheck point file のフォーマットを変更しました。
  • abinitmp20020516.exe Windows 自己解凍形式。333KB。
  • abinitmp20020516.tar.gz tar.gz形式。193KB。
• ABINIT-MP 利用マニュアル(2002/05/16版）（PDF文書, 226KB）を更新しました。
• cpf2den Ver.20020516（ABINIT-MPのcheck point fileから電子密度や静電ポテンシャルのグリッドデータを計算するプログラム）のソースコードを公開しました。使用方法については、ABINIT-MP 利用マニュアルを参照ください。
  • cpf2den20020516.exe Windows 自己解凍形式。46KB。
  • cpf2den20020516.tar.gz tar.gz形式。24KB。

• ABINIT-MP Viewer 1.03を公開しました。DNAのフラグメント表示を修正しました。また残基単位のラベル表示を改良しました。
  • ABINIT-MP Viewer 1.03 AbinitMpViewer1.03.exe （Windows 自己解凍形式。3,500KB。サンプルデータを含む。）
  • ABINIT-MP Viewer 1.03 AbinitMpViewer1.03.tar.gz （UNIX tar.gz形式。3,384KB。サンプルデータを含む。）

• ABINIT-MP Ver.20020426 abinitmp20020426.exe のソースコードを掲載しました。（Windows 自己解凍形式。1,080KB。MPICH.NT.1.2.4用の実行プログラムを含みます。）
• ABINIT-MP Ver.20020426 abinitmp20020426.tar.Z のソースコードを掲載しました。（UNIX tar.Z形式。348KB。uncompress < abinitmp20020426.tar.Z | tar xf - で解凍してください。）
  • DNAの分割方法を修正しました。DNAの計算精度が大幅に向上しています。
• ABINIT-MP 利用マニュアル(2002/04/30版）（PDF文書, 224KB）を更新しました。
  • Windows NT/2000/XP Professional の場合の、インストール方法および実行方法を修正しました。
• ABINIT-MP 解説マニュアル(2002/04/30版）を更新しました。
  • 表紙（PDF文書, 9KB）
  • 目次（PDF文書, 9KB）
  • 第1章（PDF文書, 124KB）誤植を修正しました。
  • 第2章（PDF文書, 93KB）核酸の分割方法を変更しました。
  • 第3章（PDF文書, 97KB）
• mpitest0.f90 各プロセッサのrankと、全プロセッサ数を表示するMPIテストプログラムのソースコードを修正しました。
• mpitest0.exe 各プロセッサのrankと、全プロセッサ数を表示するMPIテストプログラムのMPICH.NT.1.2.4用の実行プログラムを掲載しました。

• ABINIT-MP Viewer 1.02を公開しました。1.00と比較して、選択操作が大幅に高速化されています。
  • ABINIT-MP Viewer 1.02 AbinitMpViewer1.02.exe （Windows 自己解凍形式。3,500KB。サンプルデータを含む。）
  • ABINIT-MP Viewer 1.02 AbinitMpViewer1.02.tar.gz （UNIX tar.gz形式。2,607KB。）

• ABINIT-MPの利用条件を修正しました。

• ABINIT-MP Ver.20020329 abinitmp20020329.zip のソースコードを掲載しました。（Windows ZIP形式。310KB。解凍にはWinZip等のソフトウェアが必要です。）
• ABINIT-MP Ver.20020329 abinitmp20020329.tar.Z のソースコードを掲載しました。（UNIX tar.Z形式。348KB。uncompress < abinitmp20020329.tar.Z | tar xf - で解凍してください。）
  • SGI Origin2000 上で稼動するように修正しました。
  • コンパイル例： f90 -O -o abinitmp *.f90 -lmpi >& log.txt &
• Windows環境では、MPICH.NT.1.2.3およびNT-MPICH.1.3.0が正常に動作しないため、MPICH.NT.1.2.2のRemoteShellもしくはMPI/Pro for Windowsを使用するか、UNIX環境でご利用ください（MPICH.NTでは標準入力のredirectが、NT-MPICHでは標準出力のredirectがうまく行きません）。

• ABINIT-MP Ver.20020319 abinitmp20020319.zip のソースコードを掲載しました。（Windows ZIP形式。311KB。解凍にはWinZip等のソフトウェアが必要です。）
• ABINIT-MP Ver.20020319 abinitmp20020319.tar.Z のソースコードを掲載しました。（UNIX tar.Z形式。348KB。uncompress < abinitmp20020319.tar.Z | tar xf - で解凍してください。）
  • esp-aoc近似を用いた場合のエネルギー勾配計算のバグを修正しました。
  • エネルギー勾配計算を約2倍高速化しました。
• Windows環境では、MPICH.NT.1.2.3およびNT-MPICH.1.3.0が正常に動作しないため、MPICH.NT.1.2.2のRemoteShellもしくはMPI/Pro for Windowsを使用するか、UNIX環境でご利用ください（MPICH.NTでは標準入力のredirectが、NT-MPICHでは標準出力のredirectがうまく行きません）。

• ABINIT-MP Ver.20020228（公開版） abinitmp20020228.zip のソースコードを掲載しました。（Windows ZIP形式。解凍にはWinZip等のソフトウェアが必要です。）
• ABINIT-MP Ver.20020228（公開版） abinitmp20020228.tar.Z のソースコードを掲載しました。（UNIX tar.Z形式。391KB。uncompress < abinitmp20020228.tar.Z | tar xf - で解凍してください。）
• ABINIT-MP の可視化ソフトウェアABINIT-MP Viewerを公開しました。ABINIT-MP Viewerの実行には、 Java および Java3D が必要です。インストール方法や利用方法については、Viewer利用マニュアルをご覧下さい。
  • ABINIT-MP Viewer Ver.1.0 （ZIP形式, 2,632KB）
  • ABINIT-MP Viewer Ver.1.0 （tar.gz形式, 2,604KB）
• ABINIT-MP のドキュメントを公開しました。
  • ABINIT-MP マニュアル序文(2002/02/28版）（PDF文書, 20KB）
  • ABINIT-MP 利用マニュアル(2002/02/28版）（PDF文書, 210KB）
  • ABINIT-MP Viewer利用マニュアル(2002/02/28版）（PDF文書, 880KB）
    • sample.pdb (317KB)
  • ABINIT-MP 解説マニュアル(2002/02/28版）
    • 表紙（PDF文書, 9KB）
    • 目次（PDF文書, 9KB）
    • 第1章（PDF文書, 124KB）
    • 第2章（PDF文書, 93KB）
    • 第3章（PDF文書, 97KB）

• ABINIT-MP Ver.20020118（暫定版） abinitmp20020118.zip のソースコードを掲載しました。（Windows ZIP形式。解凍にはWinZip等のソフトウェアが必要です。）
• ABINIT-MP Ver.20020118（暫定版） abinitmp20020118.tar.Z のソースコードを掲載しました。（UNIX tar.Z形式。uncompress < abinitmp20020118.tar.Z | tar xf - で解凍してください。）
• ABINIT-MP 利用マニュアル(2002/01/30暫定版）（PDF文書）を更新しました。
• MPIのテスト用プログラムを掲載しました。
• ABINIT-MPの入力データと計算結果の掲載を始めました。

• ABINIT-MP 利用マニュアル(2002/01/18暫定版）（PDF文書）を更新しました。
• cpf2den Ver.20020118 cpf2den.zip（ABINIT-MPのcheck point fileから電子密度や静電ポテンシャルのグリッドデータを計算するプログラム）のソースコードを公開しました。使用方法については、ABINIT-MP 利用マニュアルを参照ください。（Windows ZIP形式。解凍にはWinZip等のソフトウェアが必要です。）
  • (Gly)₆ のサンプルデータ g06a.zip 803KB
    • FMO-HF/STO-3G計算のcheck point file g06a.cpf
    • 電子密度を計算する入力データ den.inp
    • 電子密度のグリッドデータ g06a_32.den
    • 静電ポテンシャルマップを計算する入力データ map.inp
    • 静電ポテンシャルマップのグリッドデータ g06a_32.map

• ABINIT-MP 解説マニュアル(2002/01/15暫定版）を更新しました。
  • 表紙（PDF文書）
  • 目次（PDF文書）
  • 第1章（PDF文書）
  • 第2章（PDF文書）
  • 第3章（PDF文書）
  • 第4章（PDF文書）

• ABINIT-MP 解説マニュアル(2002/01/07暫定版）を更新しました。
  • 表紙（PDF文書）
  • 目次（PDF文書）
  • 第1章（PDF文書）
  • 第2章（PDF文書）

• ABINIT-MP Ver.20011219（暫定版） abinitmp20011219.zip のソースコードのダウンロードを開始しました。（Windows ZIP形式。解凍にはWinZip等のソフトウェアが必要です。）
  

  このプログラムは無償かつ無保証で提供されます。このプログラムの著作権者及び配布者は、このプログラムを運用した結果に対して一切の責任を負いません。

• ABINIT-MP 利用マニュアル(2001.12.28暫定版） （PDF文書）
• ABINIT-MP 解説マニュアル(2001.12.28暫定版） （PDF文書）

• トップページを更新しました。

• フラグメント分子軌道法 参考文献 を更新しました。
• ABINIT-MPの計算結果の可視化を追加しました。

• フラグメント分子軌道法 参考文献 を更新しました。
• ABINIT-MPのインストール方法 を更新しました。

• ABINIT-MP [2000/06/30版] abinitmp20000630.f90 を掲載しました。
  • クーロンポテンシャルの計算に点電荷近似を導入しました。
• フラグメント分子軌道法の基本文献を掲載しました。
• ABINIT-MPのインストール方法・実行方法・入力データを更新しました。
• ABINIT-MPのドキュメントに分子構造総合討論会1999ポスターおよび情報化学討論会1999講演要旨を追加しました。

• ABINIT-MP [2000/04/27版] abinitmp20000427.f90 を掲載しました。
  • フラグメント−フラグメント間のクーロンポテンシャルの計算をsemi-direct化しました。必要メモリ量がO(N)に成っていますが、その分遅くなっています。
  • Self Consistent Charge (SCC)の収束判定を修正しました(Tv (energy) = 1.0e-8)。
  • SCFの収束判定を、Tv (energy) = 1.0e-10, Tv (density) = 1.0e-6, Tv (DIIS) = 1.0e-6にしました。

• ABINIT-MP [2000/04/07版] abinitmp20000407.f90 を掲載しました。
  • PDBファイルの自動フラグメント化ルーチン(automatic_fragmentation)を修正しました。
  • Self Consistent Charge (SCC)の収束判定を修正しました(Tv (energy) = 1.0e-6)。
  • Fragment SCFの収束制御を、damping procedure + DIISにしました（切り替え Emax < 0.1）。
  • Fragment Pair SCFの収束制御を、damping procedure + DIISにしました（切り替え Emax < 0.1）。
  • SCFの収束判定を、Tv (energy) = 1.0e-8, Tv (density) = 1.0e-6, Tv (DIIS) = 1.0e-6にしました。
  • 高速化のために、core MOのプロジェクションをやめて、MOを入れ替えるだけにしました。
  • SCFルーチンの、fragment_density_matrixおよびfragment_e_matrixを並列化しました（対角化ルーチンはまだ並列化されていません）。
  • フラグメント(ペア)−フラグメント間のクーロンポテンシャルルーチンを高速化しました（s,p軌道のみ対応。このためd軌道を含む計算が一時的に出来なくなっています）。

• ABINIT-MP [2000/03/24版]を掲載しました。
  • Self Consistent Charge (SCC)の収束制御を、damping procedureにしました。
  • Fragment SCFの収束制御を、damping procedureにしました。
  • Fragment Pair SCFの収束制御を、damping procedure + DIISにしました（切り替え Emax < 0.1）。

• ABINIT-MP [2000/02/17版] abinitmp20000217.f90 を掲載しました。
  • Fragment SCFの収束判定の初期値を変更しました。
  • Fragment SCFおよびfragment pair SCFの出力を抑制しました。

• ABINIT-MP [2000/01/18版] abinitmp20000118.f90 を掲載しました。
  • Fragment SCFおよびfragment pair SCFにDIIS法を組み込みました。
  • Disulfide bondを含むタンパク質の自動フラグメント分割をサポートしました。

• MPI/Pro for Windows NT Edition [1999/12/06版] abinitmp19991206.f90 を掲載しました。
  • 一電子積分のループ展開および並列化を行いました。

• MPI/Pro for Windows NT Edition [1999/11/25版] abinitmp19991125.f90 を掲載しました。
  • 原子電荷の計算ルーチンのバグを修正しました。
  • Gaussianの入力データ作成ルーチンのバグを修正しました。
  • Fragment SCFでは4-point extrapolationを使用しないように変更しました（1VIIの計算が収束しなかったため）。
  • SCFの収束判定を、エネルギーが1.0e-8、電子密度が1.0e-4に変更しました。
  • Check Point Fileを出力できるようにしました（Check point fileの拡張子は、cpf。ファイルフォーマットは今後変更予定です）。
• 1VIIの計算結果を掲載しました。

• MPI/Pro for Windows NT Edition [1999/11/16版] abinitmp19991116.f90 を掲載しました。
  • PDBファイルからの自動フラグメント化機能を組み込みました。
    • Protein Data Bank (PDB)については、http://www.rcsb.org/pdb/index.htmlを参照してください。
    • 現在は標準アミノ酸のみをサポートしています。
    • 複数のペプチド鎖は分割できますが、ジスルフィド結合を含むタンパク質は分割できません（サポート予定）。
    • 水素原子の自動生成機能はありません。水素原子が付加されていないPDBファイルは分割できません。
    • 残基番号は連続している必要があります（1から始まっている必要はありません）。
    • N末端のアミノ基の水素原子のatom typeは、'1H ','2H ','3H 'である必要があります。
    • C末端の水酸基は、C末端のアミノ酸残基と同じ残基番号である必要があります。
    • フラグメントの残基数は、module fragment内のn_fragment_residueで指定してください。
• ｢ABINIT-MPの入力データおよび計算結果｣を更新しました。

• MPI/Pro for Windows NT Edition [1999/10/21版] abinitmp19991021.f90 を掲載しました。
  • POP近似を導入しました。計算速度および使用メモリ量が大幅に改善されています。計算精度はほぼ同じです。
  • SCCの収束判定をエネルギーで1.0e-6、SCFの収束判定をエネルギーで1.0e-8、電子密度で1.0e-6と厳しくしました。

• MPI/Pro for Windows NT Edition [1999/10/19版] abinitmp19991019.f90 を掲載しました。
  • SCFおよびSCC(Self-Consistent Charge)の計算に4-point extrapolationを導入しました。
  • 2電子積分の計算を少し高速化しました（apps, dkps, ppsを再計算しないように変更）。

• MPI/Pro for Windows NT Edition [1999/09/27版] abinitmp19990927.f90 を掲載しました。
  • fragment_core_shift_operator, fragment_pair_shift_operatorのメモリ割り当てのバグを修正しました。
  • Slef-consistent charge (SCC) の収束判定を修正しました。
  • フラグメント（ペア）を計算するプロセッサの数は8に設定してあります(module abinit_mpi内 np=8)。npの決め方：プロセッサ当たりのメモリが256MBの場合に、フラグメント数が10でフラグメント（ペア）の計算に4GBのメモリが必要な分子を計算するとします。この場合、フラグメント（ペア）に16プロセッサを割り当て(np=16)、全体で160プロセッサを使用すると計算できることになります。
• ABINIT-MPのインストール方法−Hitachi SR8000の場合を追加しました。
• 分子構造総合討論会1999 講演要旨（PDF文書）を掲載しました。

• MPI/Pro for Windows NT Edition [1999/08/23版] を掲載しました。
  • フラグメント（ペア）内を並列化しました。フラグメント（ペア）を担当するプロセッサ数は、module abinit_mpi内のnpで設定しています（現在はnp=2）。また計算に使用するプロセッサ数はnpの整数倍でなければならないという制限があります。
• ABINIT-MPのインストール方法−IBM SPの場合を修正しました。

• MPI/Pro for Windows NT Edition [1999/08/11版] abinitmp19990811.f90 を掲載しました。
  • subroutine geometry_optimizationのメモリ割り当てのバグを修正しました。

• MPI/Pro for Windows NT Edition abinitmp19990803.f90 を掲載しました。
  • subroutine inputのバグを修正しました。
  • Fragment SCFの収束判定を変更しました。

• ABINIT-MP のwebページ (http://hse.nihs.go.jp/abinitmp/) を更新しました 。
• MPI/Pro for Windows NT Edition abinitmp19990802.f90 を掲載しました。
  • 電子反発積分 (Electron Repulsion Integral, ERI)の保存方法を変更しました。必要メモリが減少しています。

• ABINIT-MP 1999/07/02版を掲載しました（abinitmp19990702.f90）。
  • subroutine geometry_optimizationのメモリ割り当てのバグを修正しました。

• 第180回CBI研究講演会 「巨大分子計算のソフトウェアとその大規模並列処理によってリアリスティックモデリングを可能にする新しい分子計算法」
  • 「Ab initioペア近似法プログラム ABINIT-Pの開発 −生体高分子への応用を目指して−」 配布資料（PowerPoint文書、PDF文書）水995分子の結果を追加しました。

• ABINIT-MP 1999/06/22版を掲載しました（abinitmp19990622.f90）。
  • 1999/06/17版のマイナー修正版です。
• 第180回CBI研究講演会 「巨大分子計算のソフトウェアとその大規模並列処理によってリアリスティックモデリングを可能にする新しい分子計算法」
  • 「Ab initioペア近似法プログラム ABINIT-Pの開発 −生体高分子への応用を目指して−」 配布資料（PowerPoint文書、PDF文書）を掲載しました。
• 1999計算化学討論会 講演要旨（PDF文書）を修正しました。

• ABINIT-MP 1999/06/17版を掲載しました（abinitmp19990617.f90）。
  • メモリ使用量を削減するために、フラグメント間のクーロン積分を再計算するようにしました。
  • HF法解析的微分のd軌道部分のバグを修正しました（解析的微分はまだ並列化していません）。

• ABINIT-MP 1999/06/16版を掲載しました（abinitmp19990616.f90）。
  • フラグメントの二電子積分、およびフラグメント間のクーロン積分を再計算しないようにしました。ペプチドの計算では10倍近く高速化されています。（その分メモリ使用量も増加していますが。）
  • ndaoが関係する配列についても、動的に割り当てるようにしました。
  • HF法部分も並列化しました（並列化効率は4CPUで80%程度）。

• ndatom,ndfが関係する配列についても動的に割り当るように修正した、ABINIT-MP 1999/06/01版を掲載しました（abinitmp19990601.f90）。
• 注意点
  • デバッグは不十分です。
  • 水1000分子STO-3Gの計算が可能と思います（PCクラスター6CPU では一晩で計算が終了しなかったため、中断しています）。
  • 普通ヘッダーファイルのinclude文が入る部分が、use MPIとなっています。
  • デバッグのためすべてのプロセッサが計算結果を自分の標準出力に出すようになっています。
• 水471分子 STO-3Gの結果を掲載しました。
• 水995分子 STO-3Gの入力データを掲載しました。

• dkpsを再計算するように修正した、ABINIT-MP 1999/05/31版を掲載しました（abinitmp19990531.f90）。
• 移植の際の注意点
  • 普通ヘッダーファイルのinclude文が入る部分が、use MPIとなっています。
  • デバッグのためすべてのプロセッサが計算結果を自分の標準出力に出すようになっています。

• ABINIT-P Semi-direct 1999/04/23版を並列化し、ロードバランスを改善したABINIT-MP 1999/05/06版ができました（abinitmp.f90）。
• 移植の際の注意点
  • 普通ヘッダーファイルのinclude文が入る部分が、use MPIとなっています。
  • デバッグのためすべてのプロセッサが計算結果を自分の標準出力に出すようになっています。

• ABINIT-P semi-direct版を掲載しました。
  • abinitsd.f90 テキスト形式 511KB （UNIXでコンパイルする場合は、最後の行の^Zをvi等で削除してください。）

• 1999計算化学討論会 の講演要旨原稿（案）（Word文書, PDF文書 )を掲載しました。（PDF文書をクリックすると｢Symbol,Italic フォントの/BBoxが不正です。｣と表示されますが、｢OK｣をクリックしてください。）
• ABINIT-P（1999/03/17版）を掲載しました。フラグメントの個数に0を指定すると、PDBファイルのresidue sequence numberを見て、自動的にフラグメントに分割する機能を追加しました。主な変更部分：module atom, subroutine input, subroutine write_pdb
• 半径Rの球の中にランダムに水を発生させ、PDB形式で保存するプログラムを、residue sequence numberを付けるように修正しました。
• 水クラスターの計算結果を追加しました。
• 核酸モデル分子の計算結果を追加しました。

• ABINIT-P（1999/03/09版）を掲載しました（今回は大幅な改訂になっています）。
• COMMONブロックをすべてmoduleに変更しました。
• ペア近似法部分については、メモリを動的に割り当てるようにしました。
• 水クラスターのテスト用に、半径Rの球の中にランダムに水を発生させ、PDB形式で保存するプログラムを掲載しました。
• Poly Gly n=15,20の結果を追加しました。
• Poly Ala n=15の結果およびn=20の入力データを追加しました。
• 水クラスターの計算結果を追加しました。
• ABINIT-P サブルーチンダイアグラムを更新しました。

• ABINIT-P（1999/02/02版）を掲載しました。
• 並列化のため、一電子積分ルーチ oneint をループ分割しました（一電子積分の対角ブロックについては、重複して計算しているため、計算量は増加しています）。
• 主な変更部分：fragment_oneint, fragment_core, fragment_pair_oneint, fragment_pair_core
• ペア近似計算で、数値微分を用いた構造最適化ができます（解析的微分テスト用のため、一回の微分計算に一点計算の6*Natom倍計算時間がかかります。また、まだ十分なテストは行っていません。）

• ABINIT-P（1999/01/18版）を掲載しました。
• PDBファイルから構造データを読み込めるようになりました（現在読み込める原子は、H, C, N, O, Na, P, S のみ。拡張予定）。
• 変更部分：修正 subroutine input, 追加 subroutine read_pdb
• ABINIT-P 入出力フォーマット（Word97文書, PDF文書）を修正しました。

• ABINIT-P（1999/01/06版）を掲載しました。
• Poly Ala alpha-helix（n=2〜10）の入力データおよび計算結果を掲載しました。

• 1998/11/16版から入出力仕様を変更し、MDL MOL fileから構造データを読み込めるようにしました。また、Gaussian（.gjfファイル。直交座標形式）、PDB形式で構造データを保存できるようにしました。従来の入力データは、積分およびMOの入出力を行っていない場合、入力データファイルの3行目と4行目の間に空白行を一行挿入し、元素記号の入力を3桁左詰めに変更すると、1998/11/16版で利用できます。変更の詳細については｢APA 入出力フォーマット｣（Word97文書, PDF文書）を参照してください。